Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC9Q96Q05 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.6 ms