Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RILPQ96NA2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RILPQ96NA2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RILPQ96NA2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms