Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C9orf85Q96MD7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C9orf85Q96MD7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms