Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC42Q96M95 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC42Q96M95 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms