Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C9orf72Q96LT7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms