Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CABS1Q96KC9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CABS1Q96KC9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms