Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPD52L3Q96J77 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TPD52L3Q96J77 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms