Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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RNF185Q96GF1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RNF185Q96GF1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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RNF185Q96GF1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RNF185Q96GF1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RNF185Q96GF1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF185Q96GF1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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