Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IMP4Q96G21 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms