Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGAP3Q96FM1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PGAP3Q96FM1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PGAP3Q96FM1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms