Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEURL3Q96EH8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEURL3Q96EH8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms