Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA4Q96DD7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms