Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL29Q96CT2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL29Q96CT2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms