Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRAMD1AQ96CP6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1AQ96CP6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms