Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPTQ96BT3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPTQ96BT3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPTQ96BT3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms