Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN23Q96B33 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN23Q96B33 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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