Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NKD1Q969G9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKD1Q969G9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms