Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-CQ95604 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-CQ95604 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms