Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCC1Q92922 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCC1Q92922 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCC1Q92922 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms