Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBXN4Q92575 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
UBXN4Q92575 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBXN4Q92575 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms