Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMPDL3AQ92484 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMPDL3AQ92484 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms