Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113Q902F9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms