Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COG1Q8WTW3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COG1Q8WTW3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms