Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GIPC3Q8TF64 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms