Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX54Q8TDD1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX54Q8TDD1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms