Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHDC4Q8TBB5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHDC4Q8TBB5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms