Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYRIPQ8NFW9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.2 ms