Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PIK3C3Q8NEB9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PIK3C3Q8NEB9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms