Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCR6

SMRP1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMRP1Q8NCR6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMRP1Q8NCR6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMRP1Q8NCR6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms