Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM229BQ8NBD8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM229BQ8NBD8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms