Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG16L2Q8NAA4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms