Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AMER3Q8N944 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AMER3Q8N944 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms