Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MSL3Q8N5Y2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSL3Q8N5Y2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms