Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC33Q8N5R6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC33Q8N5R6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms