Protein–RNA interactions for Protein: Q8N183

NDUFAF2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF2Q8N183 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF2Q8N183 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF2Q8N183 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF2Q8N183 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF2Q8N183 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NDUFAF2Q8N183 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDUFAF2Q8N183 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms