Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC83Q8IWF9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC83Q8IWF9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms