Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGDCC3Q8IVU1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGDCC3Q8IVU1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGDCC3Q8IVU1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms