Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMC1Q7Z7K0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMC1Q7Z7K0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMC1Q7Z7K0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMC1Q7Z7K0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMC1Q7Z7K0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMC1Q7Z7K0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms