Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTU1Q7Z7A3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTU1Q7Z7A3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms