Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHST3Q7LGC8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CHST3Q7LGC8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms