Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP31Q70CQ4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
USP31Q70CQ4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP31Q70CQ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
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