Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC149Q6ZUS6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC149Q6ZUS6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC149Q6ZUS6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms