Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIAT1Q6ZQX7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIAT1Q6ZQX7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms