Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM72Q6ZMU5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRIM72Q6ZMU5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRIM72Q6ZMU5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM72Q6ZMU5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM72Q6ZMU5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM72Q6ZMU5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM72Q6ZMU5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM72Q6ZMU5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM72Q6ZMU5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM72Q6ZMU5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM72Q6ZMU5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM72Q6ZMU5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms