Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINGO4Q6UY18 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms