Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VITQ6UXI7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VITQ6UXI7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms