Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL17Q6UXB2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL17Q6UXB2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXCL17Q6UXB2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CXCL17Q6UXB2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL17Q6UXB2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms