Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMCO3Q6UWJ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMCO3Q6UWJ1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms