Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUX4L9Q6RFH8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DUX4L9Q6RFH8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms