Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BLOC1S2Q6QNY1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms